תוֹכֶן
ציפורים ועטלפים עפים, אבל הם חיות שונות מאוד. למעשה, הכנפיים שלהם הן הדמיון האמיתי היחיד ביניהן. בעוד שחלק ממיני הציפורים חולקים מאפיינים מסוימים עם עטלפים (למשל, ינשופים הם גם ליליים), ההגדרות הכלליות שונות מאוד.
נוצות x שיער
המאפיין המגדיר של ציפור הוא נוצותיו. כל בעל חיים עם נוצות - מיונים ועד תרנגולי הודו, תרנגולות לברווזים וכל השאר שיש בו נוצות - הם ציפורים. הם לא בהכרח צריכים להיות מסוגלים לעוף (כמו האימו), אך הם זקוקים לנוצות. העטלפים, לעומת זאת, הם יונקים, שלכולם יש שיער או שיער.
שִׁעתוּק
הריון של עטלף נקבה קורה באותה צורה כמו אצל בני אדם, פרות ויונקים אחרים - עגל מתפתח ברחמה, והיא יולדת דרך הנרתיק שלה. לעומת זאת, ציפורים מטילות ביצים. עטלף תינוק גדל בתוך אמו, בעוד שציפור תינוק גדלה בתוך ביצה.
נְשִׁימָה
לציפורים מערכת נשימה מורכבת יותר מאשר עטלפים. לעטלפים יש ריאות, כמו גם אנשים - האוויר נכנס, מעובד ועוזב באותה הדרך. מכיוון שציפורים נוטות לעוף, הן דורשות יותר חמצן. לפיכך, במערכת הנשימה של הציפור יש יותר תאים ושקי אוויר, כדי להשיג יותר חמצן במהלך הנשימה.
רְאִיָה
למרות שלעטלפים יש ראייה תקינה, הם חיות לילה. כדי לראות בחושך הם משתמשים בהדהוד המורכב משליחת גלי קול לאובייקטים והערכה של כמה זמן לוקח להם לחזור, ולכן הם משתמשים במידע זה כדי לצייר תמונה נפשית של השטח סביבם. לעומת זאת, לציפורים יש ראייה תקינה המבוססת על משטחים אור ומשקפים. לחלק מהציפורים, כמו נצים, ינשופים, יש ראייה מפותחת מאוד, אך היא מבוססת על אור ולא על קול.