תוֹכֶן
גם באקווריומים של מים מתוקים ומים מלוחים מופיעים מדי פעם כתמים חומים המאכלסים הכל: צמחים, אבנים, אביזרים וקירות האקווריום. המהירות והמראה הגרוע של כתמים כהים אלה עלולים לגרום לדאגי בעלי אקווריומים. ככל הנראה הסיכויים שזו בעיה קלה לפתרון. כנראה אצות.
דיאטומים
דיאטומים הם אורגניזמים חד תאיים עם כמוסת סיליקון וכלורופלסטים חומים, המעניקים להם צבע שבעלי אקווריומים בדרך כלל לא אוהבים. ישנם מספר מינים של דיאטומים, ורובם נמצאים במים מתוקים, אם כי חלקם חיים גם במי מלח. הם מייצרים את האנרגיה שלהם דרך האור, ולכן הם מתרבים בכל מקום שיש מים ואור. דיאטומים מתרבים במהירות ויוצרים שרשראות שהופכות למושבות, מה שמסביר את הדרך בה הם מתפשטים באקווריום שלך.
חנקות
המכונה לעתים קרובות "אצות חומות", דיאטומים זקוקים לחנקות. גידול פתאומי של אצות חומות, למרות שהוא אינו מזיק, יכול להצביע על בעיות אחרות באקווריום שלך. חנקות מיוצרות על ידי פסולת דגים, על ידי מזון דגים שלא נאכל ונרקב במיכל, ועל ידי חומר מת שהשאיר צמחי אקווריום. גידול מהיר של אצות מעיד על ריכוז גבוה של ניטראטים. נפילה פתאומית ובהמשך של חנקות עלולה להוביל למוות מאסיבי של דיאטומים, שגורם להתפרקות האצות, לרוקן חמצן במים וללחץ או אפילו להרוג דגים.
אלג'יד
בעיה אחת בה נתקלים בעלי אקווריומים היא התגובות שלהם על כתמים חומים אלה. הבעלים מכניסים אצות חיים לאקווריום כדי להרוג דיאטומים. כימיקלים אלה יכולים גם להרוג כמה אצות מועילות (כל האקווריומים זקוקים לאצות) וחיידקים מועילים. המוות הפתאומי של האצות גורם לדלדול חמצן והחומרים הכימיים השונים הקיימים באצות האצות יעשו הכל, מהשארת המים עם קצף וכלה בהריגת הצמחים ובעלי חיים אחרים, כגון חלזונות. בנוסף, לאחר מספר ימים האצות יחזרו.
שליטה באצות חומות
ניתן לשלוט על אצות חומות בכמה דרכים. בעלי אקווריומים יכולים להתחיל להשתמש במים מזוקקים במקום במי ברז למילוי אקווריומים. מי ברז מכילים בדרך כלל תרכובות סיליקון, המקדמות רבייה של דיאטומים. החול באקווריום מורכב גם מסיליקון, ולכן החלפת חול עבור ייחורים יכולה להפחית את כמות הדיאטומים. מסננים נוספים יכולים גם לעזור להפחית תרכובות סיליקון במים. באקווריומים רבים שמטופחים היטב יש דגים שאוכלים אצות ושבלולים כדי לשלוט בצמיחת האצות, וצמחים השולטים ברמות החנקות.