תוֹכֶן
פרוטוזואה וחיידקים שייכים לתחומי חיים שונים, אקריוטים ופרוקריוטים, המופרדים ביניהם על ידי גילאים ארוכים של אבולוציה. עם זאת, כמו כל צורות החיים על פני כדור הארץ, יש להם אב קדמון משותף, ולכן יש להם קווי דמיון מסקרנים. למרות המגוון המדהים של פרוטוזואה וגם של חיידקים, אפשר לבצע הכללות לגבי המשותף להם.
קוד גנטי
בפרוטיסטים, חיידקים וכל שאר האורגניזמים, כמה רצפים של זוגות בסיס כימיים של DNA מקודדים חומצות אמינו מסוימות. קוד זה הוא אוניברסלי כמעט, במובן שאותו רצף DNA יקודד את אותו רצף חומצות אמינו גם בפרוטוזואן וגם בחיידק. יוצאים מן הכלל כוללים את העובדה שחלק מהחיידקים משתמשים ברצף ה- UAG לקידוד פירוליזין במקום להיות קודון עצור, וזה מה שקורה באורגניזמים אחרים. למרות זאת, לרוב, הקוד הוא דמיון בולט בין חיידקים לפרוטוזואה.
ריבוזומים
הן חיידקים והן פרוטוזואים משדרים תחילה את ה- DNA שלהם ל- RNA, ואז מתרגמים את ה- RNA לחלבון באמצעות מבנים מורכבים הנקראים ריבוזומים. שוב, הם חולקים את הדמיון הזה עם כל צורות החיים האחרות. מבנה הריבוזומים משתנה מעט בין חיידקים לאאוקריוטים כמו פרוטוזואה. הבדל זה חשוב, מכיוון שחלק מהאנטיביוטיקה הורגת חיידקים על ידי שימוש בהבדלים בין הריבוזומים האאוקריוטיים לחיידקיים.
ממברנות תאים
גם לחיידקים וגם לפרוטוזואה יש קרומי תאים העשויים ממולקולות הנקראות פוספוליפידים. לפוספוליפיד בחיידק או פרוטוזואן יש קבוצה מסיסה במים בקצה אחד וזנב לא מסיס בקצה השני, ולכן ממברנות התאים נוצרות על ידי שכבה כפולה של רכיבים אלה. הזנב פונה למרכז השכבה הכפולה. לחיידקים יש דופן תא, בנוסף לקרום התא שלהם, עם זאת, לחיידקים מסוימים יש קרום פנימי וחיצוני.
תהליכים שמורים ביותר
חיידקים ופרוטוזואים מראים דמיון בולט בתהליכים ביוכימיים שונים, הדומים גם הם לכל צורות החיים האחרות. התהליך בו משתמשים חיידקים ופרוטוזואים לפירוק הגלוקוז נקרא גליקוליזה. למרות שיש כמה שינויים, הגליקוליזה מתרחשת כמעט בכל האורגניזמים הידועים. כמו כן, תהליך שכפול ה- DNA דומה מאוד בין חיידקים לפרוטוזואה עם כמה הבדלים קלים.
