תוֹכֶן
חיידקים שוכנים בכמויות גדולות ובמקומות רבים, בפנים ובמשטח גוף האדם. במקרים רבים, כמו במעי, נוכחות של חיידקים מועילה. נוכחותו בפה גורמת להיווצרות חללים, בנוסף להגברת הסיכון למחלות ומחלות אחרות. סוגים רבים ושונים של חיידקים חיים בפה וחלק מהסוגים פשוט מובאים על ידי כמה מזון שנצרך.
סטפילוקוקים
המינים של סטפילוקוקוס שנמצאים לרוב בפה כוללים את סטפילוקוקוס אפידרמידיס ואת סטפילוקוקוס אוראוס. לחיידקים אלה יש דופן תא עבה, המכונה חיובי גרם, ובצורתם אליפסה. אורגניזמים אלה הם פתוגנים אופורטוניסטיים, ועלולים לגרום לזיהומים בבני אדם, בהתחשב במערכת הנסיבות הטובה ביותר. מחלה בחלק אחר של הגוף עלולה לגרום להפחתה בתפקוד החיסוני וכתוצאה מכך לזיהום משני בסטפילוקוקוס.
סטרפטוקוקים
בפה, הסוג סטרפטוקוקוס מייצג חלק גדול מספירת הגוף הכוללת. Streptococcus mutans, Streptococcus mitis, Streptococcus salivarius, Streptococcus pneumoniae ו- Streptococcus pyogenes כולם חיים בפה. סטרפטוקוקים חיוביים לגראם נמצאים בטבע, בשרשרת תאי חיידק בצורת אליפסה. סטרפטוקוקוס מוטאנס הוא לא רק פתוגן פוטנציאלי, אלא גורם לחללים בשיניים. אורגניזם זה ממיר סוכרוז לחומצה לקטית. היווצרות חומצת חלב ממיסה אמייל שן. לאחר אמייל מומס, חומצת חלב יכולה להמשיך את דרכה בתוך השן ולרדת לרקמת החניכיים.
לקטובצילי
חומצה לקטית המיוצרת על ידי אורגניזמים מהסוג סטרפטוקוקוס אינה המקור היחיד לחומצה לקטית שעושה הרס בפה. בני הסוג לקטובצילוס ממירים לקטוז בחומצה לקטית, ומוסיפים חומצה נוספת הגורמת לחללים. לחיידקי לקטובצילוס צורת גזע ארוכה בעודם בעלי דופן עבה.
אי - קולי
בעוד שרוב ה- E. coli בצורת מוט בגוף נמצא במעי, כמות קטנה של החיידקים קיימת בפה. עם דופן תאים דקיקים, E. coli הוא אחד האורגניזמים השליליים הגרמים הקיימים בפה. למזונות כמו בקר טחון, ירקות ומזונות טריים אחרים יש פוטנציאל לזהם את הסביבה הטבעית. אמנם לא כל E. coli מסוכן כמו מגוון O157: H7 המתפרסם, אולם יש לראות E. coli בסביבה בה מגדל המזון כפתוגן פוטנציאלי.
