תוֹכֶן
מיזוג של שתי חברות יכול לספק להם סינרגיה וכלכלות לגודל כי להגביר את היעילות ואת הרווחים אבל חשוב להיות מודעים לכך יש גם חסרונות. מנהלי חברה העוסקת במיזוג חייבים לקחת בחשבון את החסרונות הפוטנציאליים לפני קבלת ההחלטה.
הלם תרבותי
כאשר שתי חברות להתמזג, זה לא רק השילוב של שני שמות או מותגים, אבל זה של אנשים המביאים תרבויות ארגוניות שונות. אם שתי חברות יש תרבויות שונות מאוד, קונפליקטים יכולים להתעורר. לדוגמה, אם חברה היררכית חדשנית, יזמית, שטוחה מתמזגת עם ארגון מסורתי, שמרני, היררכי מאוד, אנשים חדשים ייאבקו לעבודה משותפת.
דיסקונומיה של סולם
כאשר עסקים מתמזגים, זה קורה בדרך כלל כדי להשיג יתרון לגודל. ארגונים גדולים מסוגלים לייצר מוצרים ושירותים ביעילות רבה יותר ובעלויות נמוכות יותר ליחידה מאשר בחברות קטנות, משום שמחירים קבועים מופצים על פני מספר גדול של יחידות. עם זאת, זה לא תמיד קורה. לפעמים את גודל המיזוג של שתי חברות יכול ליצור diseconomy בקנה מידה, שבו עלות הייצור ליחידה מגדילה בשל עלויות התיאום גבוהה.
תפיסת הצרכן
כאשר שתי חברות להתמזג, יש לקחת בחשבון איך הצרכנים לראות אותם והאם הם רואים אותם תואם או לא. לדוגמה, מיזוג של חברת סבון ידידותית לסביבה עם חברה המייצרת דטרגנטים עם מסלול בלתי בר קיימא עשוי להרחיק לקוחות מן לשעבר, אשר לא יתמכו בחברה שאינה אחראית לסביבה.
פיטורים
פיוזינג שתי חברות היא דרך טובה להפחית את העבודה. לדוגמה, החברה יכולה לשלב שני משרדים לתוך אחד ולצמצם צוות המבצעים את אותן פונקציות. אמנם זה מקטין את ההוצאות של החברה, זה גם יש השפעה שלילית על העובדים. עובדים עשויים בסופו של דבר לאבד את האמון בחברה בשל הפחד לאבד את מקום עבודתם, אשר יכול להפחית את המוטיבציה, וכתוצאה מכך, את הפרודוקטיביות.